1、DNA連接酶：主要是連接DNA片段之間的磷酸二酯鍵，起連接作用，在基因工程中起作用。
2、DNA聚合酶：主要是連接DNA片段與單個(gè)脫氧核苷酸之間的磷酸二酯鍵，在DNA復(fù)制中起做用。
3、限制性核酸內(nèi)切酶：從DNA鏈的內(nèi)部進(jìn)行切割,分為限制性內(nèi)切酶和非限制性內(nèi)切酶。
4、DNA修飾酶（DNAmodification enzyme）是指對DNA分子進(jìn)行修飾的酶，目前基因工程中常用的酶有：堿性磷酸酶、末端轉(zhuǎn)移酶、甲基化酶。
5、反轉(zhuǎn)錄酶：依賴于RNA的DNA聚合酶，既可以用DNA為模板，也可以用RNA為模板進(jìn)行互補(bǔ)鏈的合成。基因工程中主要功能是利用真核mRNA為模板反轉(zhuǎn)錄cDNA，用來建立cDNA文庫，進(jìn)而分離為特定蛋白質(zhì)編碼的基因。
限制酶、DNA連接酶、DNA聚合酶與解旋酶的區(qū)別：
| 項(xiàng)目\\種類 | 限制酶 | DNA連接酶 | DNA聚合酶 | 解旋酶 |
| 作用底物 | DNA分子 | DNA分子片段 | 脫氧核苷酸 | DNA分子 |
| 作用部位 | 磷酸二酯鍵 | 磷酸二酯鍵 | 磷酸二酯鍵 | 堿基對間的氫鍵 |
| 作用結(jié)果 | 形成黏性末端或平末端 | 形成重組DNA分子 | 形成新的DNA分子 | 形成單鏈DNA分子 |
限制酶與DNA連接酶的關(guān)系：
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