2015開(kāi)年第一期《NatureMethods》雜志除了評(píng)出2014年度技術(shù)以外，還對(duì)一些熱門(mén)技術(shù)進(jìn)行了一番展望。在新的一年里，非編碼RNA（ncRNA）將依然是人們矚目的焦點(diǎn)，預(yù)計(jì)會(huì)有更多分析ncRNA功能的新方法涌現(xiàn)出來(lái)。

不編碼蛋白質(zhì)的RNA被稱為非編碼RNA（ncRNA）。從上世紀(jì)六十年代的tRNA、八十年代的rRNA、到九十年代的microRNA，ncRNA不斷刷新著人們對(duì)RNA重要性的認(rèn)識(shí)。隨著RNA測(cè)序及其衍生技術(shù)（比如CaptureSeq）的出現(xiàn)，人們發(fā)現(xiàn)了更多種類的ncRNA，比如長(zhǎng)度超過(guò)200nt且不具有開(kāi)放閱讀框的lncRNA，以及源自啟動(dòng)子、增強(qiáng)子等調(diào)控區(qū)域的短轉(zhuǎn)錄本。

人們逐漸意識(shí)到，包括環(huán)狀RNA（cRNA）、競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA（ceRNA）在內(nèi)的一些短RNA是其他ncRNA的調(diào)控者，比如microRNA。不過(guò)，大部分ncRNA的功能至今還未能明確。

為了闡明lncRNA的作用，近年來(lái)人們進(jìn)行了大量的努力和嘗試。舉例來(lái)說(shuō)，elife雜志上發(fā)表的一項(xiàng)研究通過(guò)多重敲除小鼠模型，展示了lincRNA對(duì)生命和大腦發(fā)育的必要性，為日后的大規(guī)模lncRNA功能研究奠定了基礎(chǔ)。

與此同時(shí)，人們也開(kāi)始反思目前ncRNA的分類體系。迄今為止人們已經(jīng)鑒定了數(shù)千種lncRNA，但還沒(méi)能有效區(qū)分功能性RNA和偽轉(zhuǎn)錄事件。其中部分原因是，目前RNA分類的基礎(chǔ)是技術(shù)而不是生化標(biāo)準(zhǔn)。

NatureCommunications雜志上的一項(xiàng)研究建立了一個(gè)新的RNA分類策略。研究顯示，根據(jù)RNA轉(zhuǎn)錄起始的特點(diǎn)及其對(duì)細(xì)胞核RNA外切復(fù)合體（exosomecomplex）的敏感性，可以正確而有效地分類已注釋的各種轉(zhuǎn)錄本，包括已知功能的lncRNA。這種策略能夠從大量不穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄本中鑒定出穩(wěn)定的未知lncRNA，有助于研究已知RNA和新RNA的功能。

要了解ncRNA的作用機(jī)制，我們需要知道RNA的結(jié)構(gòu)、修飾及其結(jié)合對(duì)象。此外，統(tǒng)一的命名體系可以幫助我們更好的添加新成員，明確不同ncRNA在功能上的聯(lián)系，特別是lncRNA。開(kāi)發(fā)更好的計(jì)算工具對(duì)ncRNA進(jìn)行預(yù)測(cè)，將對(duì)這一領(lǐng)域產(chǎn)生重要的影響。此外，我們也亟需更好的數(shù)據(jù)庫(kù)，以便比較ncRNA的結(jié)構(gòu)、功能和對(duì)疾病的影響。

本文來(lái)自：逍遙右腦記憶 http://m.yy-art.cn/gaozhong/338784.html

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